Muzeum prowadzi gospodarkę finansową na zasadach określonych w ustawie o organizowaniu i prowadzeniu działalności kulturalnej i innych obowiązujących w tym zakresie przepisach prawa.

Podstawą gospodarki finansowej Muzeum jest roczny plan finansowy ustalony zgodnie z przepisami ustawy o finansach publicznych przez Dyrektora z zachowaniem wysokości dotacji Województwa Podlaskiego. 

Muzeum może prowadzić, jako dodatkową, działalność gospodarczą według zasad określonych w obowiązujących przepisach, w zakresie zbieżnym lub niekolidującym z działalnością podstawową Muzeum. Działalność gospodarcza, o której mowa  może być prowadzona w następującym zakresie:

1) najmu i dzierżawy składników majątkowych;

2) usług turystycznych;

3) usług małej gastronomii;

4) usług konserwatorskich;

5) usług reklamowych;

6) prowadzenia szkoleń i wykonywania ekspertyz;

7) sprzedaży ptaków hodowlanych;

8) udostępniania muzealiów do celów pozastatutowych;

9) udostępniania powierzchni na reklamę;

10) usług handlowych, w tym np. sprzedaży pamiątek turystycznych, wydawnictw, artykułów reklamowych.  

Przychody uzyskane z działalności gospodarczej mogą być przeznaczone wyłącznie do finansowania działalności statutowej Muzeum.

Źródłami finansowania Muzeum są:

• podmiotowe i celowe dotacje przekazywane przez Organizatora;
• inne dotacje, niż wymienione w pkt 1;
• przychody z prowadzonej działalności;
• przychody ze sprzedaży lub udostępniania rzeczy i praw zgodnie z celami i zadaniami statutowymi Muzeum;
• środki otrzymywane od osób fizycznych i prawnych w drodze darowizn, spadków, zapisów, zapisów windykacyjnych oraz wpływy z innych źródeł.